Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Jam3Q9D8B7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Jam3Q9D8B7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Jam3Q9D8B7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Jam3Q9D8B7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Jam3Q9D8B7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Jam3Q9D8B7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Jam3Q9D8B7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Jam3Q9D8B7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Jam3Q9D8B7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms