Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slx4ipQ9D7Y9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slx4ipQ9D7Y9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms