Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7X1

Kctd4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd4Q9D7X1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kctd4Q9D7X1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kctd4Q9D7X1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kctd4Q9D7X1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kctd4Q9D7X1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kctd4Q9D7X1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kctd4Q9D7X1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kctd4Q9D7X1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Kctd4Q9D7X1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kctd4Q9D7X1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kctd4Q9D7X1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kctd4Q9D7X1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kctd4Q9D7X1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kctd4Q9D7X1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Kctd4Q9D7X1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Kctd4Q9D7X1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kctd4Q9D7X1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kctd4Q9D7X1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kctd4Q9D7X1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kctd4Q9D7X1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kctd4Q9D7X1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms