Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldn22Q9D7U6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cldn22Q9D7U6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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