Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem54Q9D7S1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem54Q9D7S1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tmem54Q9D7S1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tmem54Q9D7S1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tmem54Q9D7S1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tmem54Q9D7S1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Tmem54Q9D7S1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tmem54Q9D7S1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Tmem54Q9D7S1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Tmem54Q9D7S1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tmem54Q9D7S1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem54Q9D7S1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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