Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc94Q9D6J3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc94Q9D6J3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms