Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc130Q9D516 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms