Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc83Q9D4V3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc83Q9D4V3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms