Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2al3Q9D4U4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms