Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Clvs1Q9D4C9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Clvs1Q9D4C9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms