Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D454 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D454 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D454 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D454 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D454 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D454 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D454 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D454 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D454 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D454 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D454 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D454 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D454 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D454 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D454 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D454 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D454 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D454 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D454 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D454 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D454 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D454 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D454 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D454 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D454 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D454 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D454 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D454 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D454 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D454 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D454 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D454 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D454 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D454 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9D454 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D454 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D454 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D454 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D454 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D454 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D454 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D454 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D454 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D454 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D454 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D454 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D454 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D454 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D454 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D454 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9D454 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D454 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D454 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D454 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D454 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D454 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D454 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D454 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D454 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D454 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D454 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D454 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D454 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D454 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D454 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D454 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D454 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D454 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D454 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D454 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D454 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D454 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D454 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D454 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9D454 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D454 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D454 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D454 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D454 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D454 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D454 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D454 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D454 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D454 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D454 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D454 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D454 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D454 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D454 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D454 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D454 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D454 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9D454 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Q9D454 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D454 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D454 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D454 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D454 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D454 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms