Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pus10Q9D3U0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pus10Q9D3U0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms