Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krt20Q9D312 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krt20Q9D312 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms