Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx20Q9D2Y5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snx20Q9D2Y5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms