Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SarnpQ9D1J3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SarnpQ9D1J3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms