Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D1F3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D1F3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D1F3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D1F3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D1F3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D1F3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D1F3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9D1F3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D1F3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D1F3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9D1F3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms