Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cysrt1Q9D1E4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cysrt1Q9D1E4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms