Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Susd3Q9D176 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Susd3Q9D176 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms