Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M3

Cyc1, Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyc1Q9D0M3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyc1Q9D0M3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyc1Q9D0M3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyc1Q9D0M3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyc1Q9D0M3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyc1Q9D0M3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyc1Q9D0M3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms