Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpsap1Q9D0M1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpsap1Q9D0M1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpsap1Q9D0M1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpsap1Q9D0M1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpsap1Q9D0M1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpsap1Q9D0M1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpsap1Q9D0M1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prpsap1Q9D0M1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms