Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zbed3Q9D0L1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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Zbed3Q9D0L1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zbed3Q9D0L1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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