Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NkapQ9D0F4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NkapQ9D0F4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms