Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gtf2e1Q9D0D5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gtf2e1Q9D0D5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gtf2e1Q9D0D5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms