Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Ccdc47Q9D024 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc47Q9D024 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc47Q9D024 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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