Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW2

Cenpn, Centromere protein N, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpnQ9CZW2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CenpnQ9CZW2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CenpnQ9CZW2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms