Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZD5

Mtif3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtif3Q9CZD5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mtif3Q9CZD5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mtif3Q9CZD5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms