Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nde1Q9CZA6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nde1Q9CZA6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms