Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nsfl1cQ9CZ44 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nsfl1cQ9CZ44 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nsfl1cQ9CZ44 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms