Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Prelid3bQ9CYY7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Prelid3bQ9CYY7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms