Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ChtopQ9CY57 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ChtopQ9CY57 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms