Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nip7Q9CXK8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nip7Q9CXK8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms