Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmed5Q9CXE7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms