Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prdm5Q9CXE0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Prdm5Q9CXE0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Prdm5Q9CXE0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prdm5Q9CXE0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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