Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmd8Q9CX56 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmd8Q9CX56 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmd8Q9CX56 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmd8Q9CX56 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmd8Q9CX56 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmd8Q9CX56 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmd8Q9CX56 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmd8Q9CX56 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmd8Q9CX56 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmd8Q9CX56 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmd8Q9CX56 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmd8Q9CX56 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmd8Q9CX56 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmd8Q9CX56 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmd8Q9CX56 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmd8Q9CX56 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmd8Q9CX56 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmd8Q9CX56 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmd8Q9CX56 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmd8Q9CX56 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmd8Q9CX56 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmd8Q9CX56 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmd8Q9CX56 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms