Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX47

Xrcc2, DNA repair protein XRCC2, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc2Q9CX47 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc2Q9CX47 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc2Q9CX47 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc2Q9CX47 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc2Q9CX47 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc2Q9CX47 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc2Q9CX47 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc2Q9CX47 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc2Q9CX47 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc2Q9CX47 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc2Q9CX47 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc2Q9CX47 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Xrcc2Q9CX47 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc2Q9CX47 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Xrcc2Q9CX47 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Xrcc2Q9CX47 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc2Q9CX47 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Xrcc2Q9CX47 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc2Q9CX47 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc2Q9CX47 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Xrcc2Q9CX47 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Xrcc2Q9CX47 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Xrcc2Q9CX47 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc2Q9CX47 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Xrcc2Q9CX47 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Xrcc2Q9CX47 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc2Q9CX47 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc2Q9CX47 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc2Q9CX47 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Xrcc2Q9CX47 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xrcc2Q9CX47 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Xrcc2Q9CX47 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Xrcc2Q9CX47 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Xrcc2Q9CX47 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Xrcc2Q9CX47 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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