Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms