Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prkrip1Q9CWV6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prkrip1Q9CWV6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms