Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tdrd12Q9CWU0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tdrd12Q9CWU0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms