Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NubplQ9CWD8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NubplQ9CWD8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms