Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn3Q9CVD2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn3Q9CVD2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms