Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smurf1Q9CUN6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms