Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pard3bQ9CSB4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pard3bQ9CSB4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pard3bQ9CSB4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pard3bQ9CSB4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pard3bQ9CSB4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pard3bQ9CSB4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pard3bQ9CSB4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pard3bQ9CSB4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pard3bQ9CSB4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pard3bQ9CSB4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms