Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exosc5Q9CRA8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Exosc5Q9CRA8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms