Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ska2Q9CR46 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ska2Q9CR46 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms