Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR14

Fancl, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanclQ9CR14 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
FanclQ9CR14 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FanclQ9CR14 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FanclQ9CR14 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FanclQ9CR14 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FanclQ9CR14 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FanclQ9CR14 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FanclQ9CR14 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FanclQ9CR14 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FanclQ9CR14 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FanclQ9CR14 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FanclQ9CR14 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FanclQ9CR14 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FanclQ9CR14 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FanclQ9CR14 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FanclQ9CR14 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FanclQ9CR14 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FanclQ9CR14 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms