Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg12Q9CQY1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atg12Q9CQY1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms