Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PompQ9CQT5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PompQ9CQT5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms