Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Chchd5Q9CQP3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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