Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN7

Mrpl41, 39S ribosomal protein L41, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl41Q9CQN7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl41Q9CQN7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl41Q9CQN7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl41Q9CQN7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl41Q9CQN7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl41Q9CQN7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl41Q9CQN7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl41Q9CQN7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl41Q9CQN7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl41Q9CQN7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl41Q9CQN7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl41Q9CQN7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl41Q9CQN7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl41Q9CQN7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl41Q9CQN7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl41Q9CQN7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl41Q9CQN7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl41Q9CQN7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl41Q9CQN7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl41Q9CQN7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl41Q9CQN7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms