Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmed6Q9CQG0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmed6Q9CQG0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms